Sagmajster se susreo sa prvim problemima u drugoj etapi koja je vožena oko mesta Pisco u dužini specijala od 267 kilometara u dinama Ike.
Suibotički motorista vozi je u svojoj grupi kada su naišli na kolegu iz Slovenije kome je pukao lanac. Sagmajster je stao da mu pomogne i tu izgubio punih 45 minuta. Nakon toga je nastavio trku, ali imao je problema sa navigacijom kroz tešku peščanu stazu u dinama Ike. Uspeo je da završi drugi specijal na 118 mestu te se sada u generalnom plasmanu nalazi na 99 poziciji.
U konkurenciji motorista najbrži je bio Bort Bareda na Hondi koji je ovim trijumfom preuzeo vodeću poziciju u generalnom plasmanu sa minut ipo prednosti ispred Van Beverena (danas drugoplasirani) koji vozi motor marke Yamaha. Treći na današnjoj etapi bio je austrijanac Walkner. Pobednik prve etape australijanac Sunderland danas je imao zaostatak od 6 minuta nad barredom čime je pao na šesto mesto u generalnom plasmanu sa 4:20 minuta zaostatka.
Treća etapa vozi se od mesta Pisco do San Juan de Marcona u ukupnoj dužini od 504 kilometra od kojih je specijal 296 km. Karavan se i dalje nalazi u Peruu a sutrašnja etapa će takođe biti na peščanom terenu.